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FIOCRUZ | Levantamento de flebotomíneos da Terra Indígena Wajãpi, Amazônia Oriental, Brasil

Latest version published by FIOCRUZ - Oswaldo Cruz Foundation on Feb 6, 2024 FIOCRUZ - Oswaldo Cruz Foundation

To contribute to the knowledge of the epidemiology of American cutaneous leishmaniasis (ACL) among indigenous people, we studied the sand fly fauna collected in areas of transmission of the disease in the Brazilian Amazon. Our dataset is comprised of occurrence data from the Wajapi Indigenous Land (Amapa state), collected between 2013-2014. Sand flies were collected with light traps at different sites and they were mainly identified to species level by taxonomists with expertise in Amazonian fauna. These records may contribute to a better understanding of ACL transmission dynamics as well as the distribution of vectors in these areas.

Data Records

The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 3,218 records.

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Versions

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How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Shimabukuro et al. (in press). Occurrence records and metadata for sand flies (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) collected in the lands of indigenous people in the Brazilian Amazon. 2022. Gigabyte

Rights

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The publisher and rights holder of this work is FIOCRUZ - Oswaldo Cruz Foundation. To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 7140a42f-8ad6-43cd-b252-b5a791c8de4a.  FIOCRUZ - Oswaldo Cruz Foundation publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by GBIF Brazil.

Keywords

Occurrence; Observation

Contacts

Who created the resource:

Paloma Helena Fernandes Shimabukuro
Researcher/Collection curator
Fiocruz Avenida Augusto de Lima 1715 30190009 Belo Horizonte Minas Gerais BR

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Paloma Helena Fernandes Shimabukuro
Researcher/Collection curator
Fiocruz Avenida Augusto de Lima 1715 30190009 Belo Horizonte Minas Gerais BR

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Paloma Helena Fernandes Shimabukuro
Researcher/Collection curator
FIOCRUZ Avenida Augusto de Lima 1715 30190-009 Belo Horizonte Minas Gerais BR

Who else was associated with the resource:

Content Provider
Paloma Helena Fernandes Shimabukuro
Researcher/collection curator
FIOCRUZ Avenida Augusto de Lima 1715 30190009 Belo Horizonte Minas Gerais +553133497721

Geographic Coverage

Amazon domain

Bounding Coordinates South West [-1.033, -54.514], North East [2.394, -50.449]

Temporal Coverage

Start Date / End Date 2013-01-01 / 2014-01-01

Project Data

A Terra Indígena Wajãpi (TIW) está localizada na bacia do rio Araguari, no município de Pedra Branca do Amapari, no Amapá. Este povo constitui uma população de pouco mais de 1.000 pessoas, constituído por famílias que vivem da agricultura, da caça, da pesca e da coleta. Atualmente a implantação de grandes empresas de mineração e de usinas hidrelétricas no ambiente de entorno da TIW ameaça a qualidade de vida dos Wajãpi, através da degradação florestal, contaminação ambiental, e inserção da comunidade em um contexto de grande vulnerabilidade social, o que coincide com o aumento da incidência de pragas nas lavouras e enfermidades endêmicas como malária e leishmaniose. O projeto “Determinantes sócio-ambientais da leishmaniose tegumentar americana (LTA), na Terra Indígena Wajãpi, Amapá” é um projeto multi-institucional, parcialmente financiado pelo CNPq (404390/2012-9), que tem como objetivo avaliar os principais fatores de risco para a doença, utilizando para isso uma abordagem multidisciplinar. No contexto da construção e implantação da UHE de Ferreira Gomes, o projeto teve a oportunidade de estender esta avaliação na temporalidade de implantação deste empreendimento, permitindo assim, mensurar o seu impacto sobre doenças de transmissão vetorial, como a LTA. O projeto utilizou diferentes abordagens metodológicas de cunho qualitativo e quantitativo, identificando ou construindo conceitos da doença junto aos Wajãpi, visando nortear a coleta e análise de dados complementares como: levantamentos etnográficos de possíveis formas de exposição, composição vegetal, estudo entomológico, composição de estrutura de fauna silvestre e sinantrópica, e avaliação da presença de leishmânias em hospedeiros e vetores. O projeto contribuiu para a construção de um modelo de controle da doença, que a partir da compreensão das especificidades étnicas, e de utilização histórica do ambiente, gerando recomendações mais viáveis dentro do contexto regional. Além disso, a pactuação do projeto entre várias instituições federais e estaduais contribuiu para fortalecimento do serviço de atenção a saúde indígena e de vigilância em saúde no estado do Amapá.

Title DETERMINANTES SÓCIO-AMBIENTAIS DA LEISHMANIOSE TEGUMENTAR AMERICANA (LTA) NA TERRA INDÍGENA WAJÃPI
Identifier 404390/2012-9
Funding Chamada MCTI/CNPq/MS-SCTIE - Decit N° 40/2012 - Pesquisa em Doenças Negligenciadas 404390/2012-9 Fundação de Amparo à Pesquisa do Amapá, Programa de apoio ao desenvolvimento tecnológico dos sistemas de produção no Vale do Araguari – PRODETEC Araguari, subprojeto de fomento à pesquisa básica e aplicada na bacia do Rio Araguari, 004/2013
Study Area Description A TIW estende-se entre as bacias dos rios Jari (a oeste), Amapari (a leste) e Oiapoque (ao norte). Sua demarcação física foi homologada em 1996, com uma extensão territorial de 6.070 km2. A área é de floresta tropical densa e em relevo acidentado, integrando o complexo das Montanhas do Tumucumaque. Atualmente os Wajãpi somam cerca de 1.100 indivíduos, distribuídos em 80 aldeias (SESAI 2016). Nesta área predominam dois tipos de solo: o latossolo amarelo e o podzólico vermelho-amarelo. Esses solos são de baixa fertilidade natural e seu uso para agricultura e/ou pecuária exige técnica intensiva de manejo. Do ponto de vista do relevo, a região apresenta porções de áreas com dois níveis bastante ondulados ou montanhosos. Apresenta um revestimento florístico apresentado basicamente por florestas tropicais densas, observando-se a presença de capoeiras e/ou clareiras que resultam quer das práticas agrícola relacionadas a roça de coivara, quer das diversas formas de lareiras minerais que ocorrem na localidade e suas circunvizinhanças. Quanto ao clima, predomina o tipo chuvoso ("amãnaremë"), com pequeno período seco ("kwarayremë"); temperatura anual nunca inferior a 18 °C, habitat natural da vegetação megatérmica e uma pluviosidade de 2.500 mm por ano e, uma umidade relativa que fica ao redor de 80%.
Design Description O estudo de vetores foi realizado segundo duas abordagens metodológicas que envolvem captura de flebotomíneos com armadilhas luminosas. No primeiro, aos moldes padrão do MS (BRASIL, 2007; 2014), buscou-se analisar o grau de domiciliação dos flebotomíneos a partir de gradientes de distância da aldeia. Foram selecionadas 20 de 35 aldeias com registro de casos de LTA, onde foram instaladas armadilhas em ambientes dentro do espaço do pátio (intra), na interface ou transição entre o pátio da aldeia e o ambiente circundante da mesma (peri) e em ambiente de mata localizado até 100 metros de distância do pátio da aldeia (extra). As 20 aldeias amostradas segundo gradientes de distância para o pátio foram categorizadas conforme o tempo de criação e uso, a população total residente, e se é central ou periférica. Como método complementar, no intuito de identificar qualitativamente outros padrões de exposição ao ciclo da doença foram amostrados 32 cenários epidemiológicos definidos junto aos indígenas nas oficinas, distribuídos em oito categorias: árvores frutíferas, árvores com raiz em sapopema, outras plantas, rastro ou toca de animal silvestre, cursos d’àgua, matéria em decomposição, roças e criação animal. A tabela 1 apresenta os cenários epidemiológicos testados através desta metodologia. Nos dois modelos, as coletas foram realizadas em três momentos uma coleta na estação seca e duas na estação chuvosa. As armadilhas operaram entre 17h e 06h por dois a três dias em cada ciclo. Os flebotomíneos foram armazenados em frascos contendo álcool 70% ou RNALater™ (Sigma-Aldrich), e, posteriormente, triados sob estereoscópio no laboratório. As genitálias das fêmeas foram retiradas e montadas em lâminas para a confirmação da espécie que seguiu a classificação de Galati (2003); o restante do corpo foi organizado em pools e processado para a determinação da taxa de infecção natural por Leishmania. Os machos foram clarificados e montados em lâmina para a identificação das espécies, e uma porcentagem está sendo processada para identificação molecular pela ténica de DNA barcode (PINTO et al. 2015). Para cada local de amostragem foram calculados o Índice de Diversidade de Shannon-Winner (H), o Índice de Equitabilidade de Pielou (J) e a abundância relativa de espécies potencialmente vetoras segundo a literatura (CONCEIÇÃO-SILVA & ALVES, 2014). Para determinação da taxa de infecção natural por Leishmania em flebotomíneos, a extração de DNA foi realizada com o kit Puregene™ (Qiagen). A identificação de Leishmania está sendo realizada por amplificação do gene ITS1 (300-350 bp). As condições da ITS1-PCR seguiram Schönian et al. (2003) e Kuhls et al. (2005) e cepas de referência foram fornecidas pela Coleção de Leishmania do Instituto Oswaldo Cruz (Fiocruz/CLIOC) como controles positivos das reações. Após a confirmação das espécies, as amostras serão sequenciadas em analisador ABI 3730 (Applied Biosystems), e as sequências identificadas pela ferramenta BLAST do Genbank (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/). Uma análise estatística foi realizada utilizando os métodos não-paramétricos de Mann-Whiteney e Kruskal Wallis, em que foram comparados os padrões de diversidade de flebotomíneos e a proporção relativa de espécies potencialmente vetoras da LTA segundo a literatura, em relação a: tempo de existência da aldeia em anos e população total residente. Esses parâmetros foram também utilizados para análise das diferenças dos indicadores segundo gradientes de distância para o pátio da aldeia, assim como, das diferentes categorias de cenários epidemiológicos amostrados.

The personnel involved in the project:

Content Provider
Eduardo Stramandinoli Moreno

Sampling Methods

O estudo de vetores foi realizado segundo duas abordagens metodológicas que envolvem captura de flebotomíneos com armadilhas luminosas. No primeiro, aos moldes padrão do MS (BRASIL, 2007; 2014), buscou-se analisar o grau de domiciliação dos flebotomíneos a partir de gradientes de distância da aldeia. Foram selecionadas 20 de 35 aldeias com registro de casos de LTA, onde foram instaladas armadilhas em ambientes dentro do espaço do pátio (intra), na interface ou transição entre o pátio da aldeia e o ambiente circundante da mesma (peri) e em ambiente de mata localizado até 100 metros de distância do pátio da aldeia (extra). As 20 aldeias amostradas segundo gradientes de distância para o pátio foram categorizadas conforme o tempo de criação e uso, a população total residente, e se é central ou periférica. Como método complementar, no intuito de identificar qualitativamente outros padrões de exposição ao ciclo da doença foram amostrados 32 cenários epidemiológicos definidos junto aos indígenas nas oficinas, distribuídos em oito categorias: árvores frutíferas, árvores com raiz em sapopema, outras plantas, rastro ou toca de animal silvestre, cursos d’àgua, matéria em decomposição, roças e criação animal. A tabela 1 apresenta os cenários epidemiológicos testados através desta metodologia. Nos dois modelos, as coletas foram realizadas em três momentos uma coleta na estação seca e duas na estação chuvosa. As armadilhas operaram entre 17h e 06h por dois a três dias em cada ciclo. Os flebotomíneos foram armazenados em frascos contendo álcool 70% ou RNALater™ (Sigma-Aldrich), e, posteriormente, triados sob estereoscópio no laboratório. As genitálias das fêmeas foram retiradas e montadas em lâminas para a confirmação da espécie que seguiu a classificação de Galati (2003); o restante do corpo foi organizado em pools e processado para a determinação da taxa de infecção natural por Leishmania. Os machos foram clarificados e montados em lâmina para a identificação das espécies, e uma porcentagem está sendo processada para identificação molecular pela ténica de DNA barcode (PINTO et al. 2015). Para cada local de amostragem foram calculados o Índice de Diversidade de Shannon-Winner (H), o Índice de Equitabilidade de Pielou (J) e a abundância relativa de espécies potencialmente vetoras segundo a literatura (CONCEIÇÃO-SILVA & ALVES, 2014). Para determinação da taxa de infecção natural por Leishmania em flebotomíneos, a extração de DNA foi realizada com o kit Puregene™ (Qiagen). A identificação de Leishmania está sendo realizada por amplificação do gene ITS1 (300-350 bp). As condições da ITS1-PCR seguiram Schönian et al. (2003) e Kuhls et al. (2005) e cepas de referência foram fornecidas pela Coleção de Leishmania do Instituto Oswaldo Cruz (Fiocruz/CLIOC) como controles positivos das reações. Após a confirmação das espécies, as amostras serão sequenciadas em analisador ABI 3730 (Applied Biosystems), e as sequências identificadas pela ferramenta BLAST do Genbank (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/). Uma análise estatística foi realizada utilizando os métodos não-paramétricos de Mann-Whiteney e Kruskal Wallis, em que foram comparados os padrões de diversidade de flebotomíneos e a proporção relativa de espécies potencialmente vetoras da LTA segundo a literatura, em relação a: tempo de existência da aldeia em anos e população total residente. Esses parâmetros foram também utilizados para análise das diferenças dos indicadores segundo gradientes de distância para o pátio da aldeia, assim como, das diferentes categorias de cenários epidemiológicos amostrados.

Study Extent A TIW estende-se entre as bacias dos rios Jari (a oeste), Amapari (a leste) e Oiapoque (ao norte). Sua demarcação física foi homologada em 1996, com uma extensão territorial de 6.070 km2. A área é de floresta tropical densa e em relevo acidentado, integrando o complexo das Montanhas do Tumucumaque. Atualmente os Wajãpi somam cerca de 1.100 indivíduos, distribuídos em 80 aldeias (SESAI 2016). Nesta área predominam dois tipos de solo: o latossolo amarelo e o podzólico vermelho-amarelo. Esses solos são de baixa fertilidade natural e seu uso para agricultura e/ou pecuária exige técnica intensiva de manejo. Do ponto de vista do relevo, a região apresenta porções de áreas com dois níveis bastante ondulados ou montanhosos. Apresenta um revestimento florístico apresentado basicamente por florestas tropicais densas, observando-se a presença de capoeiras e/ou clareiras que resultam quer das práticas agrícola relacionadas a roça de coivara, quer das diversas formas de lareiras minerais que ocorrem na localidade e suas circunvizinhanças. Quanto ao clima, predomina o tipo chuvoso ("amãnaremë"), com pequeno período seco ("kwarayremë"); temperatura anual nunca inferior a 18 °C, habitat natural da vegetação megatérmica e uma pluviosidade de 2.500 mm por ano e, uma umidade relativa que fica ao redor de 80%. As coletas foram realizadas entre setembro de 2013 e outubro de 2014.
Quality Control Os insetos foram identificados por chaves disponíveis na literatura (GALATI, E.A.B. 2003. Classificação de Phlebotominae. In: Rangel EF, Lainson R, organizadores. Flebotomíneos do Brasil. Rio de Janeiro: Editora Fiocruz, p.23-175; Young DG, Duncan MA 1994. Guide to the identification and geographic distribution of Lutzomyia sandflies in Mexico, The West Indies, Central and South America (Diptera: Psychodidae). Mem Am Entomol Inst 54: 1-881.) e por taxonomistas experientes.

Method step description:

  1. not applicable

Collection Data

Collection Name Coleção de Flebotomíneos
Collection Identifier FIOCRUZ/COLFLEB
Parent Collection Identifier FIOCRUZ
Specimen preservation methods Mounted
Curatorial Units Between 1 and 3,219 INDIVIDUAL

Additional Metadata

Alternative Identifiers 7140a42f-8ad6-43cd-b252-b5a791c8de4a
http://ipt.fiocruz.br/ipt/resource?r=fiocruz_wajapi_01